認證課程的對象主要分為牙醫師及助理兩部分，只要按時參與學會舉辦的教育講座取得學分，另外根據不同階段的認證，需再參與筆試、口試或案例介紹等認證項目，在每年APLI大會時順利通過測驗後即可獲得證書。有興趣取得雷射專科醫師認證或是牙醫助理認證的會員可選擇相關的教育認證課程。
牙醫師認證：
雷射研究員醫師證書 Fellow Certificate
1.需修習滿30學分牙科雷射相關課程，並提供上課證明，且其中20學分需為本會主辦課程之學分。
2. 需為本會一年以上之會員資格，並完成繳交年費。
3. 須通過筆試，考試題型為50題單選題，70分以上視為及格，考試時間以60分鐘計。
4. 須見習臨床實務訓練(Hands-on Practice)。
5. 須參加二次以上年會。
雷射專科醫師證書 Diplomate Certificate
1.需修習滿60學分牙科雷射相關課程，並提供上課證明，且其中40學分需為本會主辦課程之學分。
2.需為本會二年以上之會員資格，並完成繳交年費。
3.須取得台灣世界臨床雷射醫學會雷射研究員醫師認證(Fellow Certificate)或相當之認證。
4.取得上述認證後擁有雷射儀器並實務操作滿一年以上。
5.須通過筆試，考試題型為50題單選題，80分以上視為及格，考試時間以60分鐘計。
6.須在年會上報告，準備3個案例，報告其中一個最佳案例，並繳交案例光碟一份，通過口試與Hands-on Examination，考試時間以10~20分鐘計。
7.須參加年會的海報發表。
8.須參加三次以上年會。
雷射教育家證書 Educator Certificate
1.須修習滿100學分牙科雷射相關課程，並提供上課證明，且其中60學分需為本會主辦課程之學分。
2.需為本會三年以上之會員資格，並完成繳交年費。
3.須先取得台灣世界臨床雷射醫學會雷射專科醫師認證(Diplomate Certificate)。
4.取得上述認證後擁有雷射儀器並實務操作滿二年以上。
5.參與過三次本會舉辦之學術研討會與一次以上國際學術研討會的雷射相關演講。
6.須通過專科醫師甄審委員會審議通過。
7.繳交講授課程光碟一份做為審查依據。
助理訓練：
輔導牙醫助理成為雷射牙醫診所的雷射安全官，學習雷射操作基本技巧，以及如何和病患解說雷射治療的基本常識以及如何介紹雷射療程等